درآمدها و هزينههای پژوهشکده به صورت کلی شامل موردهای زیر است:
درآمدها:
کمک دولت، کمک بخش خصوصی، در آمد طرح های پژوهشی کاربردی، شهریه دوره های آموزشی بلند و کوتاه مدت، شهریه کنفرانس ها و سایر نشست های علمی، درآمد فعالیت های انتشاراتی.
هزینه ها:
طرحهاي پژوهشي تجربي بنيادين، طرحهاي پژوهشي نظري بنيادين، طرحهاي پژوهشي كاربردي، برگزاري دورههاي عالي آموزش و تحصيلات تكميلي، برگزاري دورههاي آموزشي كوتاهمدت، برگزاري كنفرانسها و ساير جلسات علمي، همكاريهاي بينالمللي، فصلنامه، تأليف كتاب، ترجمه كتاب، انتشارات الكترونيك، تجهيز آزمايشگاهها، تجهيز كتابخانه، دستمزد كاركنان ثابت، هزينههاي نگهداری.